Hava Trafik Kontrol doktora programı 2013-2014 öğretim yılı bahar yarıyılında açılmıştır. Öğrenciler eğitimleri sonrasında Hava Trafik Kontrol alanında doktora derecesine sahip olurlar. Öğrenciler eğitimleri sırasında SIMMOD hızlandırılmış zamanlı havaalanı ve havasahası simülasyon aracı, ATC radar simülatörü ve PANS-OPS laboratuvarını kullanma olanağına sahiptirler. Aynı zamanda Anadolu Üniversitesi Havaaalanı kontrol kulesi de öğrencilere gerçek trafik ortamında proje geliştirmelerine olanak tanımaktadır.
Tezli yüksek lisans derecesiyle kabul edilenler için kaydolduğu programa ilişkin derslerin verildiği dönemden başlamak üzere her dönem için kayıt yaptırıp yaptırmadığına bakılmaksızın 8 yarıyıl olup azami tamamlama süresi 12 yarıyıl lisans derecesiyle kabul edilenler için 10 yarıyıl olup azami tamamlama süresi 14 yarıyıldır.
Gerekli kredili dersleri başarıyla tamamlamanın azami süresi; tezli yüksek lisans derecesiyle kabul edilenler için 4 yarıyıl, lisans derecesiyle kabul edilenler için 6 yarıyıldır. Bu süreler sonunda öğretim planında yer alan AKTS kredili derslerini ve seminer dersini başarıyla tamamlayamayan veya CD, DC, DD, FF, YZ veya DZ harf notu aldığı dersi/dersleri bulunan veya 3,00 GNO’yu sağlayamayan öğrencinin programdan ilişiği kesilir.
Kredili derslerini başarıyla tamamlayan, doktora yeterlik sınavında başarılı olan ve doktora tez önerisi kabul edilen ancak doktora tez çalışmasını (a) bendinde belirtilen 12 veya 14 yarıyıl sonuna kadar tamamlayamayan öğrencinin programdan ilişiği kesilir.